私家侦探伴俊作在调查一宗谋杀案时，发现疑凶上了一列作处女航的海底列车， 而列车的设计师竟然想在这次行程中毁灭这班列车。在列车行驶时，同时又发生了另一件谋杀案。列车也因为时空交错去到一个一万年前叫雾国的地方，展开了一段神秘的旅程。